Megabus ofrece un completo sistema para gestionar la venta de pasajes online, ya sea desde web o mediante aplicación móvil. Es posible aplicar promociones y restricciones a la venta, e incluir cargo de gestión. En concordancia con lo dispuesto por CNRT, el pasajero puede viajar con el boleto impreso, o conservarlo en versión digital en su teléfono o dispositivo móvil.

Megabus cuenta con el más completo y versátil software para gestión del medio de pago electrónico con tarjetas contactless. Permite ofrecer este servicio a los usuarios de transporte urbano e interurbano, con una amplia variedad de configuraciones disponibles: restricciones por tramo, día, rango horario y viajes diarios o mensuales, bonificaciones por recarga, migración de datos en caso de pérdida o destrucción del plástico, seguimiento e historial del abonado, etc. Este sistema ha sido incorporado en las provincias de Córdoba, Misiones y Mendoza para la aplicación de programas de transporte con atributos sociales (Boleto Educativo Gratuito, Boleto Obrero Social, Boleto Adulto Mayor).